《表3 拟南芥和荠菜在CaCA各亚家族的拷贝数分布情况》

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《荠菜属CaCA家族基因拷贝数变异与表达分化的研究》


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两个二倍体荠菜的基因拷贝数以及亚家族分布情况高度一致,CAX、CCX中各有5条序列,MHX和NCL中各有1条序列.四倍体荠菜中基因的拷贝数多于二倍体荠菜,在CAX中有10条序列,CCX中有9条序列,MHX和NCL中各有2条序列(表3).荠菜CaCAs基因的编码蛋白与拟南芥CaCAs在保守结构域的种类和排列上是相同的,均具有2个串联的Na_Ca_ex保守结构域(图1).荠菜与拟南芥共同的保守基序分析结果显示,同一亚家族共有一套保守基序,且保守基序的分布与CaCAs特征结构域Na_Ca_ex的分布相对应.此外,CaCAs在N端和两个保守结构域的间隔区段均存在50bp到100bp长度的可变区,除处于AtCAX2/AtCAX5/AtCAX6亚枝的序列在C端保守外,其余CaCAs成员均在C端也存在可变区(图1(b),图1(c)).