《表2 椰子、拟南芥亚家族家族成员分布表》

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《椰子ZF-HD基因家族的鉴定及生物信息学分析》

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依照与椰子基因组数据对比所得椰子ZF-HD基因家族家族成员的内含子、外显子信息，利用GSDS2.0在线绘制内含子与外显子组成图。再将其蛋白序列与拟南芥ZF-HD基因家族成员蛋白序列进行多序列比对，将得到的结果输入MA-GA7软件中，采用邻接法构建椰子ZF-HD基因家族进化树与椰子、拟南芥ZF-HD基因家族系统进化树（图1）。图1、图2根据Hu等[12]对拟南芥ZF-HD基因家族亚家族的分类，从构建所得的进化树中，可将拟南芥与椰子ZF-HD基因家族分为7个亚家族（表2），分别为ZHDⅠ、ZHDⅡ、ZHDⅢ、ZHDⅣ、ZHDⅤ、MIF、UK(unknown）。将椰子ZF-HD基因家族分为6个亚家族（表3），分别为CoZHDⅠ、CoZHDⅡ、CoZHDⅢ、CoZHDⅣ、CoMIF、UK。进化树显示，ZHDⅢ亚族中没有椰子ZF-HD基因家族成员。这是由于拟南芥为双子叶植物而椰子单子叶植物，而ZHDⅢ亚族中均为双子叶植物。UK亚家族的功能尚不知晓，其功能还尚待研究。在椰子ZF-HD基因家族中有85%(17个）的基因不含有内含子，只有外显子。这也与Irish[16]对拟南芥ZF-HD基因家族的研究保持一致。