《表2 JmjC家族成员亚家族分布》

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《石斛JmjC基因家族的鉴定及响应不同光周期的表达分析》


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基于铁皮石斛基因组数据库,以拟南芥21个成员蛋白序列分别作为探针序列,利用本地BLASTP对基因组数据库进行检索,保留E-value<10-4之内的数据,并采用NCBI-CDD、HMMER、Pfam和SMART数据库检测JmjC基因所特有的JmjC结构域,去除JmjC保守结构域不完整的序列,从原始数据中识别并筛选出了17个DoJMJ基因(表2)。