《表3 椰子亚家族家族成员分布》
依照与椰子基因组数据对比所得椰子ZF-HD基因家族家族成员的内含子、外显子信息,利用GSDS2.0在线绘制内含子与外显子组成图。再将其蛋白序列与拟南芥ZF-HD基因家族成员蛋白序列进行多序列比对,将得到的结果输入MA-GA7软件中,采用邻接法构建椰子ZF-HD基因家族进化树与椰子、拟南芥ZF-HD基因家族系统进化树(图1)。图1、图2根据Hu等[12]对拟南芥ZF-HD基因家族亚家族的分类,从构建所得的进化树中,可将拟南芥与椰子ZF-HD基因家族分为7个亚家族(表2),分别为ZHDⅠ、ZHDⅡ、ZHDⅢ、ZHDⅣ、ZHDⅤ、MIF、UK(unknown)。将椰子ZF-HD基因家族分为6个亚家族(表3),分别为CoZHDⅠ、CoZHDⅡ、CoZHDⅢ、CoZHDⅣ、CoMIF、UK。进化树显示,ZHDⅢ亚族中没有椰子ZF-HD基因家族成员。这是由于拟南芥为双子叶植物而椰子单子叶植物,而ZHDⅢ亚族中均为双子叶植物。UK亚家族的功能尚不知晓,其功能还尚待研究。在椰子ZF-HD基因家族中有85%(17个)的基因不含有内含子,只有外显子。这也与Irish[16]对拟南芥ZF-HD基因家族的研究保持一致。
图表编号 | XD00137323800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.25 |
作者 | 孙熹微、范海阔、弓淑芳、刘蕊、纠凤凤、肖勇 |
绘制单位 | 海南大学热带作物学院、中国热带农业科学院椰子研究所、海南省热带油料作物生物学重点实验室、中国热带农业科学院椰子研究所、海南省热带油料作物生物学重点实验室、中国热带农业科学院椰子研究所、海南省热带油料作物生物学重点实验室、中国热带农业科学院椰子研究所、海南省热带油料作物生物学重点实验室、中国热带农业科学院椰子研究所、海南省热带油料作物生物学重点实验室 |
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