《表1 8种豆科植物、拟南芥和水稻中的UPF0114基因家族成员》

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《中间锦鸡儿CiUPF0114克隆与表达及豆科UPF0114基因家族成员分析》

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通过对全基因组的搜索，共得到8种豆科植物和拟南芥、水稻中具有完整结构的29个UPF0114家族成员，如表1所示。其中水稻和大豆中的UPF0114基因最多，分别有4个，而其他植物中都存在2～3个。结构域鉴定后发现，除了三叶草TPR.G28382蛋白有2个UPF0114结构域以外，其他UPF0114蛋白都仅具有1个完整的结构域。绝大多数UPF0114蛋白中不存在其他的蛋白结构域，仅豇豆Vradi05g17050和三叶草TPR.G28382具有其他的结构域，如pfam05089、pfam12972和pfam12971等。因此，这2个基因的基因长度和编码蛋白也远大于其他基因。仅具有1个UPF0114结构域的27个UPF0114基因长度有较大变化，但编码蛋白长度、预测的等电点和分子量都比较接近，只有落花生Araip.9Y1W2蛋白长度明显较短，相应的等电点和分子量也与其他基因差异较大（表1）。中间锦鸡儿CiDUF0114基因编码291氨基酸，与其他植物UPF0114蛋白长度相当。