《表1 11种豆科植物dxr基因信息》

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《豆科植物dxr基因密码子偏好性分析》


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11种豆科植物的dxr基因均来自NCBI数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),见表1。决明dxr基因序列由实验室克隆获得,尚未录入NCBI数据库。大肠杆菌与酵母基因组的密码子偏好性数据来源于Codon Usage Database(http://www.kazusa.or.jp/codon/)。采用EMBOSS在线程序(http://emboss.toulouse.inra.fr.)中的CUSP(Create a codon usage table)和CHIPS(Codon heterozygosity in a protein coding sequence)以及CodonW程序分析密码子的偏好性,并用SPSS对相关基因及基因组密码子使用偏好性进行聚类分析。