《表1 不同物种中的SnRKs基因家族成员》
注:拟南芥,水稻,大麦,玉米,高粱,马铃薯序列来源于NCBI数据库
目前已经在很多植物中发现并研究了SnRKs基因家族,但是到目前为止,SnRKs基因只在拟南芥中鉴定出相对完整的三个亚家族成员:SnRK1蛋白激酶亚家族在植物中的数量较少,目前发现的只有3个;SnRK2和SnRK3蛋白激酶亚家族是植物所特有的,在植物中数量较多,目前已鉴定的SnRK2蛋白激酶亚家族的成员有10个,SnRK3蛋白激酶亚家族的成员有25个(Halford et al.,2009)。水稻、玉米等多种具有基因组信息的植物中也只鉴定到部分SnRKs基因家族成员,且主要集中于SnRK2亚家族成员,SnRK1和Sn RK3家族只有少部分成员的功能被鉴定,涉及到植物生长发育的多个方面(图1)。本综述选取了拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、玉米(Zea mays)、马铃薯(Solanum tuberosum)、小麦(Triticum aestivum)、大麦(Hordeum vulgare)、高粱(Sorghum bicolor)、大豆(Glycine max)中的SnRKs基因家族成员,利用MEGA 5.1软件对其蛋白质序列进行聚类分析,构建系统进化树。依据进化分析可以看出:在Sn RK2亚家族中,水稻中的SnRK2多与玉米、高粱等单子叶禾本科植物的SnRK2聚类在一起,而拟南芥SnRK2多与马铃薯、大豆等双子叶植物的SnRK2聚类在一起。说明水稻、玉米、高粱中的SnRK2在基因和蛋白结构上非常相似,同源性很高,而与拟南芥、马铃薯和大豆的同源性较低(表1)。该进化和同源性分析,为SnRKs基因家族的进一步研究提供参考。
图表编号 | XD0031242200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.28 |
作者 | 曾文婕、毕真真、孙超、白江平 |
绘制单位 | 甘肃农业大学甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室甘肃省干旱生境作物学重点实验室、甘肃农业大学农学院甘肃省作物抗逆种质创新与利用工程研究中心、甘肃农业大学甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室甘肃省干旱生境作物学重点实验室、甘肃农业大学农学院甘肃省作物抗逆种质创新与利用工程研究中心、甘肃农业大学甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室甘肃省干旱生境作物学重点实验室、甘肃农业大学农学院甘肃省作物抗逆种质创新与利用工程研究中心、甘肃农业大学甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室甘肃省干旱生境作物学重点实验室、甘 |
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