《表1 不同物种中的SnRKs基因家族成员》

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《植物SnRKs基因家族的研究进展》


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注:拟南芥,水稻,大麦,玉米,高粱,马铃薯序列来源于NCBI数据库

目前已经在很多植物中发现并研究了SnRKs基因家族,但是到目前为止,SnRKs基因只在拟南芥中鉴定出相对完整的三个亚家族成员:SnRK1蛋白激酶亚家族在植物中的数量较少,目前发现的只有3个;SnRK2和SnRK3蛋白激酶亚家族是植物所特有的,在植物中数量较多,目前已鉴定的SnRK2蛋白激酶亚家族的成员有10个,SnRK3蛋白激酶亚家族的成员有25个(Halford et al.,2009)。水稻、玉米等多种具有基因组信息的植物中也只鉴定到部分SnRKs基因家族成员,且主要集中于SnRK2亚家族成员,SnRK1和Sn RK3家族只有少部分成员的功能被鉴定,涉及到植物生长发育的多个方面(图1)。本综述选取了拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、玉米(Zea mays)、马铃薯(Solanum tuberosum)、小麦(Triticum aestivum)、大麦(Hordeum vulgare)、高粱(Sorghum bicolor)、大豆(Glycine max)中的SnRKs基因家族成员,利用MEGA 5.1软件对其蛋白质序列进行聚类分析,构建系统进化树。依据进化分析可以看出:在Sn RK2亚家族中,水稻中的SnRK2多与玉米、高粱等单子叶禾本科植物的SnRK2聚类在一起,而拟南芥SnRK2多与马铃薯、大豆等双子叶植物的SnRK2聚类在一起。说明水稻、玉米、高粱中的SnRK2在基因和蛋白结构上非常相似,同源性很高,而与拟南芥、马铃薯和大豆的同源性较低(表1)。该进化和同源性分析,为SnRKs基因家族的进一步研究提供参考。