《表1 不同物种DEAD-box家族成员数目比较》

《表1 不同物种DEAD-box家族成员数目比较》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《斑马鱼DEAD-box家族的分子结构特征及进化分析》


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通过鉴定和统计DEAD-box家族成员在15个物种包括哺乳类中的人(Homo sapiens)和小鼠(Mus musculus)、鱼类中的斑马鱼(Danio rerio)和青鳉(Oryzias latipes)、无颌类中的日本七鳃鳗(Lethenteron japonicum)和海七鳃鳗(Petromyzon marinus),以及其它无脊椎动物代表,如萨氏海鞘(Ciona savignyi)、玻璃海鞘(C.intestinalis)、文昌鱼(Branchiostoma floridae)、黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)、海葵(Nematostella vectensis)、海绵(Amphimedon queenslandica)、丝盘虫(Trichoplax adhaerens)和领鞭虫(Monosiga brevicollis)中的数量(表1),发现DEAD-box家族是高度保守的,且在各物种中成员数量众多。随着物种进化地位由低等至高等的变化,该家族成员的数量呈现逐渐增加的趋势。在斑马鱼中含有40个成员,小鼠和人中分别为41和42个成员,基本呈现为一一对应关系。值得注意的是,ddx61仅在斑马鱼和青鳉中被预测到,推测ddx61可能是鱼类中所特有的;ddx25、ddx50和ddx60仅存在于人类和小鼠中,ddx53仅存在于人类中,这些成员出现较晚,可能具有特殊的功能,若对这些基因的功能进行研究有可能揭示出具有物种特异性的新发现;eif4a1在斑马鱼中分为eif4a1a和eif4a1b,ddx39a在斑马鱼中存在ddx39aa和ddx39ab两个同源基因,我们推测这些基因在斑马鱼中多拷贝的出现并非全基因组复制事件,而是个别基因的加倍,因此对其成员功能研究时需要考虑多拷贝带来的功能补偿效应;而ddx19在斑马鱼中仅存在1个,这可能是复制中部分基因丢失所致。