《表2‘库尔勒香梨’miR159家族不同成员靶标预测》

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《‘库尔勒香梨’miR159家族成员进化特性及表达分析》


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注:Cleavage.裂解靶标;Translation.抑制靶标的翻译。Note:Cleavage indicates miR159 regulate targets by cleaving the mRNA at complementary base pairs;Translation indicates miR159 regulate the expression of their target genes following translation inhibition.

以‘库尔勒香梨’转录组unigene为靶标预测的数据库,采用psRNATarget软件在线预测该家族的靶基因。由表2可知,‘库尔勒香梨’的miR159a和miR159c的靶基因并不相同,psi-miR159a的靶基因为含KH结构域的蛋白质At2g38610,BES1/BZR1同源蛋白4和未表征的蛋白PAM68。psi-miR159c的靶基因为BES1/BZR1转录因子、转录因子BHLH、热激蛋白70(HSP70)、转录因子GT-1、G型凝集素S-受体类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RLK1(GsSRK)以及AGO1蛋白等。本研究揭示了‘库尔勒香梨’miR159家族在进化过程中的功能分化。