《表5 龙眼miR395家族不同成员靶标预测》
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《miR395分子进化特性及其在龙眼早期体胚发生中的表达分析》
利用龙眼转录组数据库通过psRNAtarget软件在线预测龙眼miR395的潜在靶基因。结果显示,龙眼miR395调控的潜在靶基因共有6个,且均以裂解靶标的方式进行调控(表5)。由表5可知,龙眼miR395家族不同成员靶向的基因不同,dlomiR395a靶向的基因主要是富含亮氨酸重复受体蛋白激酶LRR-RLKs、ATP硫酸化酶APS1、蛋白磷酸酶PP2C、前体RNA蛋白质TSR1同系物TSR1和酮酯酰CoA硫解酶KAT2,而dlo-miR395b-5p靶向的基因主要是EH结构域蛋白EHD1。由于龙眼miR395a和miR395b-5p序列差异较大,以致靶向的基因也有差别。且在本研究中仅dlo-miR395a预测到靶向ATP硫酸化酶(APS1),而dlo-miR395b-5p中并没有预测到与拟南芥[9]、水稻[11]、油菜[11]等植物中miR395传统意义上的靶基因APS家族或硫酸盐转运蛋白Sultr2;1,该结果与笔者课题组Li等[28]的研究结果一致。此外,龙眼miR395家族成员还可调控富含亮氨酸重复受体蛋白激酶LRR-RLKs、蛋白磷酸酶PP2C 15、前体RNA蛋白质TSR1同系物TSR1、酮酯酰CoA硫解酶KAT2、EH结构域蛋白EHD1等,提示miR395广泛参与植物的生殖生长、根毛发育及对外界环境的感知和对干旱胁迫、营养胁迫、激素响应等过程,也进一步说明了龙眼miR395功能的多样性。
图表编号 | XD00131612900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.10 |
作者 | 黄倏祺、苏立遥、蒋梦琦、赖钟雄、林玉玲 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
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