《表2 龙眼miR156a靶基因预测》

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《龙眼miR156家族及其调控靶标SPL的生物信息学和表达模式》

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龙眼miR156a作为miR156家族保守性最强的成员，并且在龙眼mRNA文库中Reads数最高.因此以miR156a为对象，采用psRNAtarget在线软件，将龙眼转录组数据库作为靶标数据库进行靶基因预测.结果如表2所示，miR156a的靶标为SPL基因家族的SPL2、SPL6、SPL9、SPL16、SPL18.采用改良RLM-RACE，在龙眼体胚材料中检测到SPL基因（SPL6/9/16）被切割的mRNA片段.结果显示，miR156a在与靶基因mRNA互补的第10个核苷酸处切割靶标mRNA（图5）.靶基因氨基酸序列比对分析表明，SPL6、SPL9和SPL16的序列之间具有差异性，然而SPL6/9/16均具有高度保守的SBP结构域（图6），该结构域具有富含半胱氨酸和组氨酸的SQUAMOSA启动子.miR156a的结合位点在SBP结构域的下游.结果显示，在龙眼体胚中存在与拟南芥相似的miR156-SPL信号转导途径，进一步表明这些途径在植物当中是保守的.