《表2 龙眼miR403靶基因预测》
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《龙眼miR403及其候选靶标对外源激素的响应模式以及在龙眼体胚中的表达模式》
以龙眼转录组数据库和龙眼AGO2全长序列作为miR403靶标数据库,采用在线软件psRNAtarget预测龙眼miR403的靶标基因.结果显示,miR403共预测出41个候选靶基因,其中21个基因于NCBI中已被注释(表2),而剩下的20个基因均显示为未知蛋白(数据未显示).同时,对miR403靶基因分析发现,候选靶标中并未包含已在其他植物中被验证出来的AGO2.而psRNAtarget所预测的miR403与AGO2的结合位点显示,miR403抑制AGO2的方式有4个位点为翻译抑制,有1个位点为切割抑制,且这5个位点的期望值均较大,推测龙眼中miR403不调控AGO2.
图表编号 | XD0097733300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.25 |
作者 | 苏立遥、黄倏祺、蒋梦琦、厉雪、徐小萍、陈旭、赖钟雄、林玉玲 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所、福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
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