《表4 龙眼miR395家族成熟体序列》

《表4 龙眼miR395家族成熟体序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《miR395分子进化特性及其在龙眼早期体胚发生中的表达分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

为进一步了解龙眼miR395成熟体进化特性,利用系统进化树及序列比对分析所有物种miR395的成熟体,发现包括龙眼(2条)在内307条miR395成熟体中有249条来自于3p臂,58条来自5p臂;通过进化分析,提示miR395家族非常保守,而从龙眼miRNA文库中得到龙眼miR395成熟体序列7条:dlomiR395a、miR395d-5p、dlo-miR395h、dlo-miR395k、dlo-miR395l*、dlo-miR395o和dlo-miR395w(表4)。用miRbase(22.1版)在线软件,对龙眼的miR395成熟体与其他所有登录物种的miRNAs进行比对,发现其中3条miR395与其余物种的miR395比对不上,且相似于其他miRNA。如dlo-miR395k与ppcmiR8315-5p相似度为70%,与nve-miR-9449相似度为63%,dlo-miR395l*与spu-miR-4851相似度为65%,dlo-miR395w与dvi-miR-9694-3p相似度为59%。利用DNAMAN 6.0比对分析龙眼pre-miR395与miR395成熟体,这3条成熟体均在3p臂,但是其相似度非常低(图4),说明它们都不属于miR395家族;dlo-miR395h和dlo-miR395o在3p臂分别有6个和4个碱基的突变,也暂不考虑。根据上述分析,提示龙眼miR395成熟体有2条:dlo-miR395a、dlomiR395d-5p,由于dlo-miR395d-5p来自于premiR395b的5P臂上,将dlo-miR395d-5p更名为dlomiR395b-5p。