《表1 植物miR398家族成熟体序列分布及信息统计》
梳理miRBase 22.0数据库中收录的植物miR398家族的成熟体、前体序列信息。由表1可知,来自34种植物共82条miR398成熟体序列已正式公布(数据统计截止2019年5月)。其中,来自10种植物共17条miR398成熟体位于前体的3’端,来自33种植物共65条miR398成熟体位于前体的5’端。54条成熟体序列已被实验验证,12条成熟体序列经同源比对获得,16条成熟体序列仍待验证。来自18种植物共61条miR398家族前体序列及对应的155条靶标序列已正式公布(数据统计截至2019年5月)。此外,对植物miR398家族成熟体、前体及其靶标序列进行植物学分类。由表1和图1可知,miR398家族成员在植物界中分布广泛(共32属19科),既有被子植物(31种),也有裸子植物(2种),还有藻类植物(1种)。双子叶植物中发现的miR398家族成员信息最多,其中,亚麻(Linum usitatissimum)和琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)中发现的miR398家族成熟体最多(6条),刺苞菜蓟(Cynara cardunculus)中发现的miR398家族前体序列最多(6条),拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的发现的miR398家族靶标序列最多(43条)。互叶梅(Amborella trichopoda)作为原始的被子植物(既不能归为单子叶也不能归为双子叶植物)各发现1条miR398成熟体和前体序列,紫球藻(Porphyridium purpureum)作为低等的单细胞藻类植物也发现1条miR398成熟体序列。
图表编号 | XD00142670700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.15 |
作者 | 高帆、何中石、宋韡、徐璐、赵佳 |
绘制单位 | 山西大学生命科学学院、山西大学生命科学学院、山西体育职业学院、山西大学生命科学学院、山西省农业科学研究院生物技术研究中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |