《表1 31种植物miR-398-3p基因家族成熟序列及其基因定位》

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《与植物抗逆相关的miR-398-3p基因家族进化分析及靶基因预测》


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利用生物信息学方法,在miRBase数据库中在线检索所有物种中的miR-398-3p,结果见表1。由表1可知,31个植物物种中存在miR-398-3p,大部分miR-398-3p基因分散在不同的染色体上,也有少部分miR-398-3p基因位于同一染色体上,如ath-miR398b、ath-miR398c、mtr-miR398a-3p、mtrmiR398b成熟序列分别位于拟南芥和蒺藜苜蓿的5号染色体上,vvi-miR398b和vvi-miR398c成熟序列都位于葡萄6号染色体上。此外,火炬松、南欧丹参、刺菜蓟、无油樟、白菜、花生、小麦、陆地棉、甜橙、向日葵、烟草、高粱、甘蓝miR-398-3p基因家族成员都只有1个拷贝,其余的都是多拷贝,如拟南芥miR-398-3p基因家族成员有3个拷贝、水稻miR-398-3p基因家族成员有2个拷贝。