《表2 初定位分子标记的引物序列及其在Col和Ler基因组上的物理位置》

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《拟南芥全基因组精细插入及缺失分子标记》

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在众多分子标记中，PCR检测多态性（如CAPS、SSLP、AFLP、RAPD）因操作相对简单、结果直观可靠成为标记首选[3，22]。针对拟南芥而言，在TAIR数据库中，由于大多数分子标记并非同时开发，研究者需要事先对试验条件进行优化，一些分子标记往往不能使用相同的PCR反应体系和扩增条件，使得操作变得繁琐。本研究针对新开发的2 321个INDEL标记，设计了至少1对或多对（共计4 764对）可供选择的引物（At＿In Del＿Marker[23]和表2）。重要的是，我们初步测试的20个分布于5条染色体的分子标记可采用相同的PCR条件得到稳定的结果（图4），这大大提高了工作效率。通过该研究能够方便研究者找到合适的分子标记，在常见的仪器条件和较低的试验成本下可快速进行突变体基因定位。