《表3 基因初定位所用Indel标记和SNP标记》

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《黄金苗谷子苗期黄色的生理基础和黄苗基因初定位》

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为定位黄金苗黄苗基因，首先构建了F2分离群体。在F2群体中分别选择绿苗和黄苗的叶片取样，构建了绿苗植株和黄苗植株的DNA混池，并进行高通量测序。2个混池的测序结果进行比较分析，利用QTLseq软件作图，结果显示在5号染色体35～40M、7号染色体30～35M、8号染色体12～18M都有一个明显的连锁峰值，且阈值Δ（SNP-Index）大于0.3。分别设计InDel和SNP引物（表3）对每条染色体上的候选区间进行验证，排除了5号和7号染色体，确定目的基因定位于8号染色体12～18M区间，但未能在该区间开发出2个材料之间有多态性的标记，精细定位该基因需要构建新的多态性群体。