《表1 grc2关联标记SNP验证所用引物信息》

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《SLAF-seq BSA定位水稻黄叶转绿基因grc2的效果研究》

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*以'93-11'为参考基因组*The data is based on the reference genome of'93-11'

从候选关联区段的前、中、后端各挑选1～2个AM进行关联性验证。首先，根据各关联标记在'Y58S'和'grc2'中的SNP信息，设计特异性引物扩增及测序该位点，验证SNP的真伪（引物信息见表1）；然后，从'Y58S'/'grc2'的F2群体中随机挑选80个隐性单株来计算AM与grc2基因的重组值，推断其关联程度。最后，利用BLAST工具将AM比对至粳稻“日本晴”的参考基因组（http://plants.ensembl.org/Oryza＿sativa/Info/Index）上；在日本晴背景下，比较该关联区段与传统图位定位区域即Chr06的0.88～0.91 Mb（谭炎宁等，2015）之间的物理位置差异。