《表3 甘蓝型油菜湿害胁迫响应性状WLRI显著关联的SNP标记》

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《甘蓝型油菜湿害胁迫响应性状的全基因组关联分析及候选基因预测》


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a、b、c、d标注的为对不同湿害胁迫响应性状耐湿系数关联分析所检测到的相同SNP位点。缩写同表1。

为了较好地控制关联分析的假阳性和假阴性,利用32,839个有效SNP位点,基于na?ve、Q、PCA、K、K+Q和K+PCA六种模型对湿害胁迫响应的8个性状进行关联分析,结果如图6、图7和表3所示。根据各性状的WLRI,基于6种模型的-lg(P)观察值与期望值的接近程度,选择最佳模型。最终,SDW和RFW的最佳模型为Q模型,SFW和GLN的最佳模型为PCA模型,RDW的最佳模型为K+Q模型,POD、MDA和Protein的最佳模型为K+PCA模型。