《表3 锌胁迫下甘蓝型油菜发芽期相对下胚轴长显著关联的SNP位点》
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《锌胁迫下甘蓝型油菜发芽期下胚轴长的全基因组关联分析》
对相对下胚轴长度的QQ图进行分析(图3),结果表明,K+Q模型检测到的标记的P值较其他模型更接近期望值,其降低了假阳性,关联分析结果更可靠。全基因组关联分析共检测到8个显著关联的SNP位点(图3和表3),分别位于A02、A07、C04和C06染色体上,单个SNP解释的表型变异为22.0%~33.2%。为了确定显著关联SNP位点的候选基因区间,本研究对这些关联位点的染色体进行LD分析,利用R2值估计LD,A02和A07染色体的衰减距离为300 kb,C04染色体衰减距离为700 kb,C06染色体的衰减距离为1 Mb (图4-A)。另外,A07染色体上22.2 Mb~23.9 Mb与C06染色体34.9 Mb~37.2 Mb位于共线性区间内(图4-B),说明找到的显著关联的SNP位点位于这2个共线性区间内。
图表编号 | XD00210690500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.12 |
作者 | 魏丽娟、申树林、黄小虎、马国强、王曦彤、杨怡玲、李洹东、王书贤、朱美晨、唐章林、卢坤、李加纳、曲存民 |
绘制单位 | 西南大学农学与生物科技学院、油菜工程研究中心、西南大学现代农业科学研究院、西南大学农学与生物科技学院、油菜工程研究中心、西南大学现代农业科学研究院、西南大学农学与生物科技学院、油菜工程研究中心、西南大学现代农业科学研究院、西南大学农学与生物科技学院、油菜工程研究中心、西南大学现代农业科学研究院、西南大学农学与生物科技学院、油菜工程研究中心、西南大学现代农业科学研究院、西南大学农学与生物科技学院、油菜工程研究中心、西南大学现代农业科学研究院、西南大学农学与生物科技学院、油菜工程研究中心、西南大学现代农业科学 |
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