《表2 株高及其耐低氮胁迫系数的显著关联SNP位点》

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《不同氮素条件下黄淮麦区小麦株高全基因组关联分析》

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加粗标记表示在高、低氮环境均与株高性状关联；下划线表示该标记在两个环境中与株高耐低氮胁迫系数相关

利用来自于Affymetrix Wheat 55K SNP芯片的7 948个SNP标记，结合8个环境的株高表型数据及其BLUP值进行关联分析。共检测到分布于1B、1D、2A、2B、2D、3B、4D、5A、6B和7D共10条染色体上的13个SNP位点，在3个以上环境中与株高表型显著相关，可解释9.6%～26.6%的表型变异（图1；表2）。其中，位于1B （2）、3B及7D上的4个显著相关位点可在高、低氮环境中稳定检测到（表2）。位于1B染色体约94.9 Mb位置的AX-111586591在E1、E2、E4、E6、E8和BLUP环境下被重复检测到，对表型贡献率为9.6%～17.7%、位于1B染色体约566 Mb区间的AX-109857753可在E1、E5、E7环境下被重复检测到，其表型贡献率为11.8%～17.1%；位于1D染色体约457.2 Mb处的AX-111306420可在E3、E4和BLUP环境下稳定检测到，表型变异为11.0%～12.7%；位于2A染色体239 Mb附近的AX-111530205在E2、E6和E8环境下被重复检测到，表型变异为9.0%～17.3%；在E1、E8和BLUP环境下可重复检测到位于2B染色体610 Mb位置的AX-109856351，表型变异为12.5%～19.3%；在E3、E4和BLUP环境下可重复检测到位于2D染色体600 Mb处的AX-110991640和AX-110477999，解释11.5%～16.4%的表型变异；位于3B染色体738 Mb位置的AX-108895818在E1、E7和BLUP环境下被重复检测到，表型变异为12.0%～15.8%；在E2、E6和E8环境下可稳定检测到位于4D染色体445 Mb位置的AX-109880021，表型变异为10.4%～13.0%；在E2、E4和BLUP环境下，可稳定检测到位于5D染色体550Mb位置的AX-111519500，表型变异为11.2%～15.1%；位于6A染色体319 Mb处的AX-110068299在E6、E8和BLUP环境下被重复检测到，表型变异为10.2%～14.0%；在E6、E8和BLUP环境下可稳定检测到位于6B染色体317 Mb附近的AX-111545041，表型变异为10.5%～14.0%；位于7D染色体上的AX-108824683在除E2环境外的其他7个和BLUP环境下都能检测到，可解释高达26.6%的表型变异。结合曼哈顿图和LD单体型块图判断，新位点定位在AX-110386339～AX-94409926区间内（图2）。