《表1 与花期性状相关的显著关联SNP位点》
采用TASSEL V 5.0软件MLM模型,对519份MAGIC群体材料进行开花期的全基因组关联分析,如图2、3所示。其中共检测到13个与开花期显著关联的位点(p<0.000 1)(表1),分别位于烟草第4、5、6、8、12、13、15、17、19号染色体上,根据p值排序,在烟草全基因组染色体上的物理位置分别为:12号染色体,109 616 410 bp;8号染色体,2 266 918 bp;8号染色体,135 192 920 bp;17号染色体,43 342 018 bp;6号染色体,74 138 868bp;4号染色体,35 423 572 bp;4号染色体,91 394779 bp;12号染色体,57 703 873 bp;13号染色体,76 563 713 bp;15号染色体,21 104 329 bp;5号染色体,138 720 068 bp;6号染色体,146 052 300bp;19号染色体,40 502 891 bp;其中,4、6、8号染色体分别检测出2个显著性位点,12号染色体上109 616 410 bp处的SNP位点显著性最高,p值为4.79;单个位点表型变异贡献率(R2)范围为3.38~4.74%,其中最显著位点的表型贡献率为4.49%。
图表编号 | XD00216387600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.01 |
作者 | 孙滢、姜自鹏、刘洪泰、孙明铭、蒋彩虹、任民、刘旦、罗朝鹏、张剑锋、杨军、杨爱国、程立锐 |
绘制单位 | 中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国烟草总公司郑州烟草研究院、中国烟草总公司郑州烟草研究院、中国烟草总公司郑州烟草研究院、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所 |
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