《表5 META分析TNB和NBA显著关联SNP位点》

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《基于50K SNP芯片技术对金华猪和嵊县花猪繁殖性状的全基因组关联分析》

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在金华猪和嵊县花猪混合群体中，共鉴别到1个与TNB相关、达到基因组水平显著的SNP位点，17个达到染色体水平显著的SNP位点（表5）。其中最显著SNP位点WU＿10.2＿14＿140199680的P值为1.58E-10，邻近于NANOS1基因。另外有14个SNP位点位于5号染色体，这些SNP邻近或座落于INTS13、GUCY2C、GRIN2B、FAM234B、B C AT 1、A E B P 2、H E L B、S R G A P 1、S L C 3 5 E 3、KRAS基因。SNP位点H3GA0016291和ALGA0031876位于6号染色体，邻近于MIIP基因。对于NBA，共鉴别到3个SNP，其中1个达到基因组显著水平的SNP和TNB达到显著的SNP位点相同，邻近基因为NANOS1。另外2个达到染色体水平显著的SNP分别位于2号和5号染色体，分别邻近于SPINK9、CRY1基因。金华猪、嵊县花猪、META分析TNB和NBA关联分析曼哈顿图如图3～5所示。