《表6 昌7-2测交群体显著相关的SNP位点》

《表6 昌7-2测交群体显著相关的SNP位点》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于4个测交群体玉米籽粒品质相关性状关联分析》


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对籽粒蛋白质含量而言,E28测交群体在bin5.01检测到与蛋白质含量相关的SNP位点,郑58测交群体在bin1.07、bin5.03、bin5.05、bin6.06检测到与蛋白质含量相关的SNP位点。Goldman等(1993)在这些区段中也检测到了与蛋白质含量相关的位点,并且在bin5.03检测到了2次。Wassom等(2008)都在bin5.03检测到了与蛋白质含量相关的QTL位点。对籽粒油分含量而言,Mo17测交群体在bin5.07、bin7.03检测到与油分含量相关的SNP位点;E28测交群体在bin5.07检测到与油分含量相关的SNP位点;昌7-2测交群体在bin1.1检测到与油分含量相关的SNP位点;郑58测交群体在bin1.11、bin4.06、bin5.07、bin6.01、bin6.06、bin8.03检测到与油分含量相关的SNP位点。Yang等(2016)在这些区段检测到与油分含量相关的QTL位点。董青松等(2018)在bin1.1和bin6.01分别检测到与油分含量相关的SNP位点,其中bin1.1的SNP位点连续两年被检测到。Wassom等(2008)也在bin1.1、bin7.03检测到与油分含量相关的QTL位点。对籽粒赖氨酸含量而言,Mo17测交群体在bin3.05定位到与赖氨酸含量相关的SNP位点,E28测交群体在bin2.03、bin3.08定位到与赖氨酸含量相关的SNP位点。Liu等(2016b)也在这些区段定位到了与赖氨酸相关的SNP位点,其中在bin2.03、bin3.08都重复检测到2个SNP位点。以上研究均利用自然群体、RIL、DH、F2、BC等传统定位群体,对玉米籽粒品质相关性状进行QTL定位,本研究定位结果与前人比较发现,4个测交群体中存在极少数与前人定位一致的位点或区域,这些定位一致的位点或区域极有可能是控制籽粒品质相关性状的热点区域。但是,有大量的SNP位点与前人研究的QTL位点不重叠,前人基于玉米多个测交群体全基因组关联分析研究较少,初步判断是品质性状在F1当代遗传效应较为复杂所致。针对这些差异位点的研究,后续将采用当前多种关联分析的新方法(冯建英等,2016),寻找这些差异位点在不同方法间的共位点,筛选出的这些共位点可靠性更强,挖掘这些位点的候选基因,采用蛋白质,代谢等组学分析的方法对重要基因进行深入研究,更加直接、深入的揭示玉米杂交种品质性状的遗传机理。玉米生产上利用的是杂交种,基于自然群体、RIL、DH、F2、BC等传统定位群体的关联分析或连锁分析定位的位点或区域是对杂交种间接的研究。因此,不应该忽略对揭示杂种当代目标性状遗传机制的研究。此研究是对传统连锁分析和关联分析群体定位结果的有益补充。