《表5 甘蓝型油菜湿害胁迫响应性状耐湿系数候选基因相关信息》
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《甘蓝型油菜湿害胁迫响应性状的全基因组关联分析及候选基因预测》
显著性标记所在Block区间共包含71个候选基因(图8和表5),其中BnaA04g09210D、BnaA09g24580D、BnaC04g29550D、BnaC04g29560D、Bna C05g06560D、BnaC05g06730D和BnaC05g06770D共7个未Blast到同源的拟南芥基因,其余64个均可通过同源的拟南芥基因注释预测其功能,它们主要编码转录因子(如BnaA02g17270D,transcriptioninitiation factor IIF;BnaA09g24610D,bZIP68;Bna A10g24150D,myb-like HTH transcriptional regulator family protein),转运蛋白(如BnaA04g09160D,SUC2),液泡蛋白质分拣蛋白[如BnaC05g05880D,vacuolar protein sorting 41(VPS41)],生长抑制子(如BnaC04g29580D,ING2),DNA/RNA结合蛋白[如BnaC05g06750D、BnaC05g06760D和BnaC05g 06810D,basic helix-loop-helix(bHLH)DNA-binding superfamily protein;BnaC05g06790D,RNA-binding(RRM/RBD/RNP motifs)family protein],酶类(如Bna C05g06690D,protein phosphatase 2C family protein;BnaA04g09140D,UDP-glucose 6-dehydrogenase family protein;Bna A04g09150D,HXXXD-type acyl-transferase familyprotein;BnaA04g09230D,saccharopine dehydrogenase;BnaA09g24570D,alpha/beta-Hydrolases superfamily protein),激素响应蛋白[如BnaA02g17300D,SAUR-like auxin-responsive protein family;BnaA09g26170D,auxin response factor 8(ARF8);BnaA10g24140D,arginine decarboxylase 2(ADC2);BnaC05g06520D,nuclear factor Y(NF-YC9)],氧化胁迫、渗透胁迫、盐胁迫或水分剥夺响应蛋白[如BnaC05g06500D,EARLY RESPONSE TO DEHYDRATION 6(ERD6);BnaC05g06530D,NPK1-related protein kinase 1(NP1);BnaC04g20480D,TIR-NBS-LRR;BnaC05g06780D,calreticulin 1b(CRT1b)]等。BnaC04g29570D和BnaC05g06590D所编码的蛋白功能未知。
图表编号 | XD00112623800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.12 |
作者 | 李阳阳、荆蓉蓉、吕蓉蓉、石鹏程、李欣、王芹、吴丹、周清元、李加纳、唐章林 |
绘制单位 | 西南大学农学与生物科技学院、西南大学农业科学研究院、重庆市油菜工程技术研究中心、西南大学农学与生物科技学院、重庆市油菜工程技术研究中心、西南大学农学与生物科技学院、西南大学农业科学研究院、重庆市油菜工程技术研究中心、西南大学农学与生物科技学院、西南大学农业科学研究院、重庆市油菜工程技术研究中心、西南大学农学与生物科技学院、西南大学农业科学研究院、重庆市油菜工程技术研究中心、西南大学农学与生物科技学院、西南大学农业科学研究院、重庆市油菜工程技术研究中心、西南大学农学与生物科技学院、西南大学农业科学研究院、重 |
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