《表3 SNP标记在甘蓝型油菜参考基因组上的分布》

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《甘蓝型油菜多主花序性状的表型特点与遗传分析》


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所用油菜60K Illumina Infinium SNP芯片中共含有52 157个均匀分布在油菜全基因组上的SNP标记,其中在两个混池中共检测到6753个变异位点,分析数据后发现,有972个位点在两个混池中存在差异,这些位点分布于19条染色体,其中468个位点位于A亚基因组,504个位点位于C亚基因组,即A01-A10、C01-C09(表3)。其中A亚基因组中A05染色体和C亚基因组C04染色体差异位点数明显多于同组其它染色体上变异位点数(图3),这就说明控制多主花序的基因很有可能在这两条染色体上。然后统计A05染色体上和C04染色体上差异位点的分布频率(图4)。从图中可以看出:A05上在4~8Mb之间和C04染色体上16~24Mb之间出现峰值。由此,我们将这两个区间作为多主花序基因定位的候选区间。同时我们在C04染色体上设计的SSR引物全都不具有多态性,所以我们在接下来的研究中将A05染色体作为研究的重点。