《表3 所用SNP标记：人工合成小麦SHW-L1高硒含量KASP分子标记开发及其应用》

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《人工合成小麦SHW-L1高硒含量KASP分子标记开发及其应用》

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将得到的QTL与图谱进行对照，以获得一个更大的QTL区间，区间内的SNP作为初筛选标记。根据SNP分型结果与籽粒硒含量数据进行比对再筛选（图1），总共分为3种，A型、B型和缺失。理想中的标记应该为A型和B型分离，并以某个籽粒硒含量的材料为界限，完全分布于两侧，但完全符合的标记基本不存在，因此，要从初筛选的标记中做二次筛选，只需选出基因型聚类较好的标记即可，最终选出5个标记用于开发籽粒硒含量相关的KASP分子标记（表3）。根据5个标记设计引物（表4），其中如AX-1引物包括2条等位基因特异性正向引物AL1和AL2，一条共同的反向引物R。