《表1 抗性基因BnALS1R的KASP分子标记引物序列》

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《油菜抗咪唑啉酮类除草剂基因标记的开发与应用》


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下画线黑体碱基表示SNP位点。The underlined and bold bases indicate SNP loci.

M9与常规油菜宁油16、宁油18编码ALS家族中BnALS1的核苷酸序列存在1处SNP[12],根据该处SNP可开发KASP分子标记检测抗性基因BnALS1R。将己克隆的BnALS1R基因序列与野生型序列比对,明确SNP在油菜BnALS1基因的第1913位。以候选SNP位点为中心提取两侧50 bp侧翼序列,设计2组KASP分子标记引物,每组标记由3条引物组成,其中2条特异引物3'末端为等位变异碱基G/A,且在5'端分别连接英国LGC公司KASP反应试剂特定的FAM和HEX荧光接头序列。通用引物的序列选择要保证扩增片段在60~120 bp(表1)。