《表1 56对引物信息:大白菜软腐病抗性相关基因分子标记的开发》

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《大白菜软腐病抗性相关基因分子标记的开发》


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*加粗的限制性内切酶为筛选标记在F2群体上选用的内切酶

本实验室前期研究中分析了大白菜软腐病防御反应基因的表达情况,获得一批大白菜软腐病抗性相关功能基因ESTs(远方,2005),这些基因序列成为本研究EST-PCR和EST-CAPS(cleaved amplified polymorphic sequence)标记开发的基础。通过软件DNAStar 5.0对ESTs序列进行片段重叠群分析(参数:最小序列长度为20 bp,最小匹配百分比为95%)。对于具有明显多态性的ESTs两端保守序列,通过软件Primer Premier 5.0设计EST-PCR及EST-CAPS标记引物(共计56对,表1)。引物由上海生工生物技术服务有限公司合成。