《表3 SLAF的类型及其数量占比分析》

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《SLAF-seq BSA定位水稻黄叶转绿基因grc2的效果研究》

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以籼稻品种'93-11'为参考基因组，经同一位点reads序列的相似性聚类后，获得了50 601个携带1个或多个等位基因的SLAF，进而推算出亲本与混池的测序深度分别为83.7×和460.6×，4个样品的平均深度为272.2×。根据SLAF在双亲间有无多态性及其多态性的表现形式，将SLAF划分成单核苷酸多态性标记（SNP）、重复序列、无多态性和未知类型等4种类型；其中，SNP（记为SLAF marker）共有5 302个，占SLAF总数的10.47%（表3）。