《表1 SNP位点筛选所用引物》
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《团头鲂hepcidin基因单核苷酸多态性及与抗病性状的相关性》
从GenBank中查找到hepcidin基因mRNA序列(GenBank:JQ308841.1),从团头鲂全基因组序列[17]中查找获得hepcidin基因的DNA全序列。用Primer premier 5.0软件设计引物(hepcidin-s1、hepcidin-s2和hepcidin-s3)(引物序列详细信息见表1) ,从易感和抗病组中各随机选择5尾鱼的DNA为模板,扩增hepcidin基因。PCR反应体系共25μL:DNA模板0.5μL,ddH2O 10.5μL,PrimeSTAR Max DNA polymerase 12.5μL,上下游引物各0.75μL。使用Veriti梯度PCR仪(德国Eppendorf公司)进行扩增:95℃变性10s,58℃退火5s,72℃延伸5s,循环35次。琼脂糖凝胶电泳后与DNA Marker的条带对比,挑选明亮、单一、清晰条带的扩增产物送武汉擎科公司进行测序。采用DNAstar软件进行序列比对和峰图分析,筛选出SNP位点。同时,对团头鲂hepcidin基因DNA序列和mRNA序列进行比对分析,绘制团头鲂hepcidin基因结构图。
图表编号 | XD0034549000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.03.01 |
作者 | 孙千惠、田万平、罗航、王卫民、刘红 |
绘制单位 | 华中农业大学水产学院、农业农村部淡水生物繁育重点实验室、华中农业大学水产学院、农业农村部淡水生物繁育重点实验室、华中农业大学水产学院、农业农村部淡水生物繁育重点实验室、华中农业大学水产学院、农业农村部淡水生物繁育重点实验室、华中农业大学水产学院、农业农村部淡水生物繁育重点实验室 |
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