《表2 实验用SNP分型引物》
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《团头鲂hepcidin基因单核苷酸多态性及与抗病性状的相关性》
SNP位点分型参照文献[16],在筛选出的hepcidin基因2个SNP位点附近,用Primer premier5.0软件设计分型引物(表2),采用HRM方法在Roche LightCycler480荧光定量PCR仪上进行SNP分型,用LightCycler480软件中的Genescaning程序对结果进行分析。HRM反应设置阴性和阳性2个对照,每个样品均分型3次,之后选取每种类型各2个产物送武汉擎科公司进行测序,以确定产物的具体基因型。SNP分型体系参照文献[18]为:ddH2O 13.1μL,Es Taq 0.2μL,Es buffer 2.5μL,Eva Green 1.0μL,上下游引物各0.4μL,dNTPs(10mmol/L)0.4μL,30ng/μL DNA模板2.0μL,共20μL。SNP分型程序:95℃预变性5min;95℃变性1min,58℃退火10s,72℃延伸15s,重复此循环45次。HRM曲线采集程序:95℃1min;40℃1 min;65℃1s;自65℃起按25次/℃变化率连续搜集荧光值,按0.02℃/s的温度变化率采集熔解曲线,至95℃结束。
图表编号 | XD0034548900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.03.01 |
作者 | 孙千惠、田万平、罗航、王卫民、刘红 |
绘制单位 | 华中农业大学水产学院、农业农村部淡水生物繁育重点实验室、华中农业大学水产学院、农业农村部淡水生物繁育重点实验室、华中农业大学水产学院、农业农村部淡水生物繁育重点实验室、华中农业大学水产学院、农业农村部淡水生物繁育重点实验室、华中农业大学水产学院、农业农村部淡水生物繁育重点实验室 |
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