《表1 MLST分型用CD基因引物》
提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《自建分子检测方法在腹泻患者艰难梭菌感染调查中的应用》
参照文献[7]设计CD 7个管家基因的引物作为分型检测引物,见表1。对tpi阳性的粪便标本提取粪便DNA后进行CD 7个管家基因adk、dxr、atpA、tpi、sodA、glyA、recA的PCR扩增,测序后进行MLST分型。采用40μL的PCR反应体系,包括DNA模板2μL,上下游引物各1μL,premix rtaqDNA聚合酶20μL、ddH2O 16μL。扩增条件:95℃预变性15min;94℃变性30s,50℃退火40s,72℃延伸70s,共35个循环,最后72℃延伸5min。琼脂糖凝胶电泳检测电泳条带,然后将PCR产物测序,测序序列与数据库(http://pubmlst.org/clostridium difficile)进行对比,得到特定位点的等位基因号,将等位基因组合形成相应的等位基因谱,与数据库进行比对后获得菌株型别。
图表编号 | XD00219551800 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.04.14 |
作者 | 于翔、杨昆豫、李嘉嘉、把丽美、毛小琴 |
绘制单位 | 云南省第一人民医院、昆明理工大学附属医院、云南省第一人民医院、昆明理工大学附属医院、云南省第一人民医院、昆明理工大学附属医院、云南省第一人民医院、昆明理工大学附属医院、云南省第一人民医院、昆明理工大学附属医院、云南省临床微生物分子研究中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |