《表3 用于QTL qSH11.1定位的InDel分子标记引物序列》

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《基于广西普通野生稻染色体片段代换系的落粒性QTL鉴定及相关主效QTL定位》

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CSSL-Y99与93-11的落粒性存在明显差异，是一个完全落粒性的CSSLs，所携带的qSH11.1表型贡献率（-23.4%）在6个落粒性QTLs中最高。CSSL-Y99的代换片段位于第11染色体的C11-4～C11-11区间，通过与CSSL-Y303、CSSL-Y106-3和CSSL-Y274的代换片段重叠而将qSH11.1缩小至CSSL-Y99、CSSL-Y303和CSSL-Y106-3的重叠片段上，即第11染色体的C11-5～C11-8区间。参考测序结果，本研究在qSH11.1所在区间内开发6对InDel分子标记（M1、M2、M3、M4、M5和M6）（表3），从构建的次级F2群体分析中筛选出4个重组单株（43、167、128和136），基于重组单株的基因型和表型，可将qSH11.1定位于InDel分子标记M5和M6间约1.5 Mb的范围内（图5)，LOD值为25.0。