《表1 Pid3和Pid3-A4特异性InDel分子标记引物序列》

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《抗稻瘟病Pid3/Pid3-A4基因特异InDel分子标记开发与应用》

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基于Pid3单倍型特异的26 bp缺失序列，设计了InDel分子标记Pdg-C（表1）。利用该标记，可以在含有Pid3单倍型水稻材料地谷中扩增出一条274 bp的条带，而在分别含有Pid3-A4、Pid3-Hap6和Pid3-Hap9[9]单倍型的野生稻A4、栽培稻93-11和日本晴中扩增出一条300 bp的条带（图2-A）。类似地，基于Pid3-A4单倍型特异的9bp缺失序列，设计了InDel分子标记PA4-C（表1）。利用该标记，可以在携带Pid3-A4单倍型的野生稻A4中扩增出一条212 bp的条带，而在含有Pid3、Pid3-Hap6和Pid3-Hap9单倍型的其他水稻材料中扩增出一条221 bp的条带（图2-B）。结果表明设计的Pdg-C和PA4-C标记可以只通过电泳条带大小特异识别Pid3基因和Pid3-A4基因。