《附表1 用于OsDWL1基因定位的分子标记》

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《水稻矮化宽叶突变体osdwl1的生理特性和基因定位》

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利用osdwl1/02428的F2群体中具有矮化及宽黄叶性状的673个单株作为基因定位群体。为了定位Os DWL1基因，首先分别提取osdwl1/02428 F2群体中的10株野生型表型和10株具有矮化宽叶性状的单株基因组DNA，分别等量混合成正常基因池和突变基因池。合成水稻12条染色体上的500对SSR标记及50对In Del标记，逐条对02428和突变体osdwl1进行多态性分析，而后选用均匀分布于12条染色体上的多态性分子标记，利用BSA法分析其与Os DWL1基因间的连锁性关系。结果发现水稻6号染色体短臂上的SSR标记RM7399、RM19288、RM3805和RM19549与Os DWL1紧密连锁。利用这4个标记对osdwl1/02428的F2群体中的673个矮化宽叶单株进行基因型分析，发现RM7399、RM19288、RM3805和RM19549的交换单株分别是80、23、19和121株，初步将Os DWL1基因定位在RM19288和RM3805之间。为进一步精细定位Os DWL1基因，继续合成位于RM19288和RM3805之间的10对SSR和In Del标记（附表1），其中2对标记在02428和突变体osdwl1间存在多态性，利用这2对标记将Os DWL1基因限定在RM19297与ID269-2之间，物理距离约333 kb，横跨AP001168、AP002838、AP000391和AP000559四个BAC （图6），其间有EST支持的ORF为37个（http://rapdb.dna.affrc.go.jp/viewer/gbrowse/irgsp1/）（表2）。