《表1 用于云南地方稻资源籼粳鉴定的InDel分子标记》

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《基于InDel分子标记的云南地方稻籼粳属性与表型性状相关分析》

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InDel引物参照Shen等（2004）、Lu等（2009）基于典型粳稻日本晴和典型籼稻9311全基因组DNA序列比对获得的45对InDel分子标记，选取30份不同来源且表型性状差异明显的地方稻资源进行InDel分子标记筛选，最终选出39对覆盖水稻12条染色体且在30份表型差异地方稻资源中均能扩增出与对照品种带型一致的InDel分子标记（表1），委托上海捷瑞生物工程有限公司合成。PCR反应体系及扩增程序参照陈越等（2019）的方法，扩增产物用4.0%琼脂糖凝胶进行分离，经核酸染料染色后在紫外灯下用BioRAD凝胶成像仪拍摄，并分析电泳结果。对于未出现电泳条带的DNA材料重新进行PCR扩增，重复3次仍未出现则作缺失条带处理。