《表1 精简后可用于鉴定117份种质资源的一套12个核心SNP标记信息》

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《基于全基因组SNP高效鉴定水稻种质资源并构建指纹图谱》

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本研究通过新方法筛选出的12个核心SNP标记分别分布在稻瘟病抗性基因、异乔木萜醇合酶、WRKY转录因子等7条染色体上的12个基因上。对位于基因内的28 562个SNP的PIC值进行分布统计（图1），并计算的12个SNP标记的PIC值（表1）。结果表明基因内的28 562个SNP的多态性有高有低，但有大量SNP具有高多态性（35.1%的SNP标记PIC>0.4，23.2%的SNP标记PIC>0.45）。筛选出来的12个SNP标记83%具有高多态性（PIC>0.45），但也有2个SNP的多态性较低，分别为0.35和0.26。说明基因上有大量高多态性的SNP，筛选出来的12个SNP标记也有很大一部分是高多态性的，但是低多态性的SNP标记对于指纹图谱的构建也有一定价值的。