《表1 亚家族中各物种磷酸蔗糖磷酸酶基因数目统计》
运用BLAST和HMMER软件分析各基因组测序数据为依据获取蛋白质模型,从而获取SPP基因序列(王鹏等,2018);使用FigTree v1.4.2软件绘制进化树的结果。SPP基因在9种不同物种系统发育树中均鉴定出4条拟南芥家族基因且功能已得到验证(https://www.araport.org/)。从系统进化树中可以明显的统计出各物种所占SPP基因的数目,Ⅰ亚家族在被子植物中均没有鉴定出,其中衣藻均没有鉴定出来;裸子植物所占的数目是2条;Ⅱ亚家族在低等植物中均没有鉴定出,在被子植物中,拟南芥所占的数目最多(4条),甜橙所占的数目最少(1条),而水稻和番茄所占的数目是相同的(2条);由此表明SPP基因在被子植物后开始趋于稳定(表1;图3)。
图表编号 | XD00152889700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.28 |
作者 | 白蓓蓓、王佳、叶秀旭、刘咲頔、陈华蕊、陈业渊 |
绘制单位 | 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所、海南大学热带作物学院、中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所、海南大学热带作物学院、中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所、中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所、海南大学热带作物学院、中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所、中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 |
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