《表3 不同物种TCP基因数目比较》

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《芥菜TCP转录因子家族全基因组鉴定及表达分析》


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TCP转录因子是植物特有的一类转录因子家族,参与植物生长发育中的多种生理过程[7]。随着分子生物学技术的发展普及,TCP转录因子家族基因相继在拟南芥、水稻、番茄、黄瓜、苹果及葡萄等物种得到鉴定。在拟南芥和水稻基因组中分别发现24和21个TCP基因[23],黄瓜中鉴定22个[17],葡萄中鉴定15个[21],番茄中鉴定36个[24],苹果中鉴定52个[25]。但芥菜TCP家族基因成员还未见报道。本研究采用生物信息学的方法对芥菜全基因组数据库进行检索,共鉴定出53个芥菜TCP转录因子家族基因成员,并利用生物信息学方法对其进行较为系统全面的分析。与不同物种的TCP基因数量进行对比(表3),各物种间有较大差异,甘蓝型油菜TCP基因数量含量多,含78个,芥菜次之。