《表3 SOX5基因在不同物种组织中的表达及分子功能》

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《籽鹅羽束性状分析及SOX5候选基因生物学功能预测》


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注:(1)DNA结合(GO:0003677) ;(2)转录因子活性(GO:0003700) ;(3)转录调节活性(GO:0030528) ;(4)蛋白异二聚体活性(GO:0046982) ;(5)蛋白二聚体(GO:0046983)。

经SMART软件对鹅SOX5基因在禽类进行分子功能预测,后生动物中预测出8 871种功能基因;脊索动物中预测出7 125种功能基因;其中鸟类中预测出427种功能基因,在雁形目中包含69种功能基因(绿头鸭67种、天鹅1种、小天鹅1种),这些功能基因均与转录因子活性、DNA结合相关;应用David软件在其他物种中预测结果见表3。应用MEGA 6.06软件构建基因进化树,发现鹅SOX5基因与隼形目鸟类基因存在较高的同源性,见图4。通过SMART软件对鹅SOX5基因保守结构域进行预测,其氨基酸序列长度与NCBI网站中相同,能够转录翻译成具有生物学功能的蛋白质,可用于后续生物学分析,见图5。以上对鹅SOX5基因进行的生物信息学预测结果证明,该基因在转录过程中具有一定调控机制,且广泛参与机体生长发育过程。