《表2 HD-Zip在不同物种中数目情况统计》

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《辣椒HD-Zip基因家族鉴定、系统进化及表达分析》


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为进一步明确HD-Zip基因家族进化特征,分别选取无油樟(Amborella trichopoda)、水稻(Oryza sativa)[19]、玉米(Zea mays)[19]、番茄(Solanum lycopersicum)[17]、马铃薯(Solanum tuberosum)[27]、辣椒‘CM334’、辣椒‘Zunla-1’、毛果杨(Populus trichocarpa)[28]、葡萄(Vitis vinifera)[18]以及拟南芥[1]9个代表物种进行分析(表2、图5)。与孑遗植物无油樟相比,HD-Zip在其余8种植物中具有不同程度的倍增(表2),证明其在不同的进化过程中被不均等的复制保留下来。系统进化树分析表明,包含无油樟在内这9个物种的HD-Zip序列不均等的分布在4个亚族中,说明从被子植物开始,HD-Zip基因家族就稳定存在4个亚族。在这9个物种中,I亚族含有最多的数目,而III数目最少(图5-A),证明在被子植物全基因组复制过程中I亚族复制保留的基因最多,而III亚族基因没有发生复制或复制后丢失。这也侧面证明III亚族基因可能相对比较保守。