《表7 不同方法选出的基因匹配成功的基因数目》

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《用于样本聚类和网络分析的整合鲁棒结构化NMF模型》

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本节以PEH数据集为例，分别利用5种整合模型构建基因共表达网络.根据构网结果和评估指标S分别为每种方法筛选出前10、50、100个基因并与Gene Cards(http://www.genecards.org/）中PAAD、ESCA、HNSC的相关基因比对.表7给出了每种方法选出的基因中同时与3个癌症的相关基因库匹配成功的基因个数.从结果来看，我们的方法选出的基因在相关基因库中所占的比例更高.为了使结果更清晰，以韦恩图的形式给出了每种方法筛选出的前100个基因在对应癌症的相关基因中找到的个数，如图4所示.