《表1 筛选出的23个铁皮石斛Hsf基因家族成员》
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《铁皮石斛热激转录因子(Hsf)基因家族鉴定及生物信息学分析》
以拟南芥和水稻Hsf蛋白的氨基酸序列为参考序列,搜索获得铁皮石斛同源蛋白序列,去除不含HSF结构域和重复冗余的Hsf蛋白后,共获得23个铁皮石斛Hsf基因家族成员,经SMART和Pfam数据库鉴定发现均具有HSF保守结构域,最后根据进化分组对其进行命名(表1),其中有13个HsfA组成员、9个HsfB组成员和1个HsfC组成员,但仅HsfA组成员包含完整的CC功能域,HsfB和HsfC组成员缺少或含不完整的CC功能域。铁皮石斛Hsf蛋白的氨基酸数量为132~514个,平均343个,分子量为15147.48~56695.63 Da,理论等电点(pI)4.76~9.10,73.91%属于酸性蛋白,除DoHsfA3外,其他铁皮石斛Hsf蛋白总平均疏水指数均为负值,属于亲水蛋白。
图表编号 | XD0051601800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.01 |
作者 | 韩利红、刘潮、张维维、李发、邓发虎、阮子恒 |
绘制单位 | 曲靖师范学院生物资源与食品工程学院、曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心、曲靖师范学院生物资源与食品工程学院、曲靖师范学院生物资源与食品工程学院、曲靖师范学院生物资源与食品工程学院、曲靖师范学院生物资源与食品工程学院 |
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