《表2 铁皮石斛Hsf基因启动子区的顺式作用元件数量》
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《铁皮石斛热激转录因子(Hsf)基因家族鉴定及生物信息学分析》
A:脱落酸响应元件;B:茉莉酸响应元件;C:赤霉素响应元件(TATC-box);D:水杨酸响应元件;E:生长素响应元件;F:赤霉素响应元件(P-box);G:厌氧诱导调控元件;H:脱水响应元件;I:干旱响应MYB结合位点;J:低温响应元件;K:损伤响应元件;L:防御和胁迫响应元件;M:病原激发子响应元件;N:分
为了解铁皮石斛Hsf基因在植物生长发育中的作用及对胁迫响应的能力,使用PlantCARE对铁皮石斛Hsf基因启动子区顺式作用元件进行预测,结果如表2所示。除了最基本的TATA-box和CAAT-box外,铁皮石斛Hsf基因启动子区含大量的激素响应、胁迫响应和生长相关元件,其中启动子区含脱落酸响应元件(ABRE)的Hsf基因占56.5%,含茉莉酸响应元件(CGTCA-motif)的Hsf基因占65.2%,含赤霉素响应元件(TATC-box和P-box)和水杨酸响应元件(TCA-element)的Hsf基因占34.8%,含生长素响应元件(TGA-element)的Hsf基因占17.4%,含厌氧诱导必需的顺式作用元件(ARE)的Hsf基因占73.9%,含脱水响应相关元件(MYB-like sequence)的Hsf基因占47.8%,含干旱响应MYB结合元件(MBS)、低温响应元件(LTR)、损伤响应元件(WUN-motif)及防御和胁迫响应元件(TC-rich repeats)的Hsf基因均占21.7%,含病原激发子响应元件(W box)的Hsf基因占26.1%。除此之外,34.8%和21.7%的Hsf基因启动子区分别含分生组织表达相关顺式调控元件(CAT-box)和胚乳表达相关顺式调控元件(GCN4_motif)等。
图表编号 | XD0051602000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.01 |
作者 | 韩利红、刘潮、张维维、李发、邓发虎、阮子恒 |
绘制单位 | 曲靖师范学院生物资源与食品工程学院、曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心、曲靖师范学院生物资源与食品工程学院、曲靖师范学院生物资源与食品工程学院、曲靖师范学院生物资源与食品工程学院、曲靖师范学院生物资源与食品工程学院 |
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