《表1 HaNAC42启动子区主要顺式作用元件》
采用Plant CARE网站在线分析HaNAC42启动子区域可能存在的顺式作用元件,预测显示位于起始密码子ATG上游147 bp的位置为转录起始位点(TSS),标记为+1(图2)。分析表明HaNAC42启动子包含大量TATA-box(TATA)和CAAT-box(CAAT)植物启动子的基础转录元件。通过Plant CARE进一步分析HaNAC42启动子,发现存在多个与逆境胁迫相关的顺式作用元件(图2;表1),其中包含脱落酸响应元件ABRE(TACGTG)1个,光响应元件G-box(TACGTG)2个,赤霉素响应元件GARE-motif(TCT GTTG)1个,热激应答元件HSE(AAAAAATTTC)1个,参与干旱诱导的MYB结合元件MBS(TAAC TG)1个,胚乳表达调节元件Skn-1_motif(GTCAT)3个,防卫和逆境应答元件TC-rich repeats(ATTT TCTCCA)1个,水杨酸反应响应元件TCA-element(CCATCTTTTT)1个,生长素响应元件TGA-element(AACGAC)1个,节律调控元件Circadian(CAANN NNATC)1个。此外还发现2个响应茉莉酸甲酯的作用元件CGTCA-motif(CGTCA)和TGACG-motif(TGACG)。
图表编号 | XD002172700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.25 |
作者 | 姜子焱、姚正培、王波、任燕萍、马丽、王泽、张桦 |
绘制单位 | 新疆农业大学农学院新疆农业大学生物技术重点实验室、新疆农业大学农学院新疆农业大学生物技术重点实验室、新疆农业大学农学院新疆农业大学生物技术重点实验室、新疆农业大学农学院新疆农业大学生物技术重点实验室、新疆农业大学农学院新疆农业大学生物技术重点实验室、新疆农业大学干旱区荒漠研究所、新疆农业大学农学院新疆农业大学生物技术重点实验室 |
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