《表4 CSSL23、CSSL153和9311启动子区特有顺式作用元件》

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《基于染色体置换系的普通野生稻耐盐性QTL定位》

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CSSL23、CSSL153均包含qSSR5.1、qSSG5.1，两个被定位于SNP标记S5＿27886769附近的苗期耐盐相关QTL，该区域内存在已定位的非生物胁迫相关基因OsDi19-1[15]，对其序列分析发现，野生稻与9311在该基因编码区无差异，但启动子区存在较大差异。如图7所示，CSSL23、CSSL153（野生稻片段）与9311存在7个插入缺失，23处核苷酸变异。利用在线软件plantCARE(http：//bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/）对启动子区域进行分析发现，CSSL23、CSSL153与9311间特有的顺式作用元件有3个，分别为与应激反应相关的转录结合基序WUN-motif[16]、参与光反应的保守基序ATC-motif、阻遏蛋白结合的重要基序CTAG-motif[17]（表4）。Real-time PCR结果表明，盐胁迫条件下，该基因在9311中的表达量显著高于CSSL23、CSSL153（图8）。