《表4 筛选出的与5个穗部性状关联的候选基因》

《表4 筛选出的与5个穗部性状关联的候选基因》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《海南短日照条件下谷子穗部性状的全基因组关联分析》


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从与性状显著关联SNP位点所在的连锁不平衡区域检索到与穗长相关联的基因有24个,与穗粗相关联的基因有33个,与穗码数相关联的基因有18个,与穗粒质量相关联的基因有18个,与千粒质量相关联的基因有22个。表3为这些基因在GO、NR、Swiss Prot、COG、KEGG等功能数据库的注释情况。根据注释情况,从候选基因中进一步筛选出一些关键的目标基因,其中选出与穗长关联的目标基因4个,分布在Chr3、Chr5、Chr7、Chr8等4条染色体上,这些基因主要功能包括信号传递、泛素-蛋白酶系统介导的蛋白质降解、蛋白质运输及防御反应;与穗粗关联的基因有9个,分布在Chr1、Chr2、Chr3、Chr5、Chr6、Chr8等6条染色体上,这些基因主要功能包括信号转导、木质素合成、RNA加工、赤霉素合成、赖氨酸组氨酸转运等;与穗码数关联的基因有5个,分布在Chr2、Chr3、Chr4、Chr8等4条染色体,主要功能包括泛素-蛋白酶系统介导的蛋白质降解、光系统Ⅱ合成、信号传递、防御反应、脂肪酸合成;与穗粒质量关联的基因有8个,分布在Chr1、Chr2、Chr3、Chr5、Chr6、Chr7等6条染色体上,主要功能包括木质素合成、信号转导、防御反应、细胞运动、泛素-蛋白酶系统介导的蛋白质降解;与千粒质量关联的基因有7个,分布在Chr1、Chr2、Chr3、Chr4等4条染色体,主要功能有信号转导、防御反应、脂肪酸合成、锌离子运输、泛素-蛋白酶系统介导的蛋白质降解等(表4)。