《表1 拟南芥、水稻、大豆、胡萝卜和毛果杨PHD家族基本信息》
注:“-”表示PHD家族个别基本信息在此物种中未提及。
不同植物中PHD家族的基因数目各不相同。如表1所示,大豆有45条[8]、水稻有59条[9]、毛果杨有73条[10]、拟南芥有70条[11]、胡萝卜有106条[12]。大豆中PHD家族的基因数目最少,胡萝卜中最多。蛋白长度范围比较大,在74~2 336aa之间。不同物种中PHD基因的内含子数各不相同,内含子数量在10个以内居多,也有个别物种基因中无内含子。等电点变化范围为4.46~9.87,其中水稻(54%)和毛果杨(53%)中大部分为酸性蛋白。对PHD基因在拟南芥、水稻、大豆和毛果杨染色体上的分布进行分析(表2)发现,PHD基因都是不均匀地分布在各自物种的染色体上。植物PHD基因的重复事件共分为两种,即串联重复和大片段复制。其中拟南芥、水稻、毛果杨中基因的扩增主要依赖于大片段复制,在拟南芥和毛果杨中串联重复基因只有两对(表3)。
图表编号 | XD00218953900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.30 |
作者 | 姚依秀、李玉林、何艳军、高杰、范敏 |
绘制单位 | 浙江省农业科学院蔬菜研究所、新疆农业大学林学与园艺学院、浙江省农业科学院蔬菜研究所、新疆农业大学林学与园艺学院、浙江省农业科学院蔬菜研究所、新疆农业大学林学与园艺学院、浙江省农业科学院蔬菜研究所 |
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