《表2 毛果杨5个Ptr ZFP基因序列特征》
通过查找,共获得5条毛果杨PtrZFP基因。进一步序列分析发现这5个基因具有完整的开放读码框,因此推测为全长基因,命名为PtrZFP1-5。5个Ptr ZFP蛋白都至少具有一个典型的锌指蛋白结构域。其中,PtrZFP2和PtrZFP5属于CCCH类型,其他3个PtrZFP转录因子均属于C2H2类型。这5个PtrZFP基因编码蛋白推测的氨基酸残基数为258~338 aa,预测的分子质量数为27.7~37.3 kDa,理论等电点为4.87~8.61(表2)。预测Ptr ZFP1定位于细胞外周质,Ptr ZFP2定位于细胞质,而Ptr ZFP3-5定位于细胞外膜(表2)。DNA结构分析发现,PtrZFP2和PtrZFP5分别包含1或2个内含子序列,其他转录因子没有内含子序列(图1)。此外,PtrZFP2和PtrZFP5的motif基序数目多于其他转录因子(图1)。基因在染色体上的定位结果显示,5条基因不均匀的分布在3条染色体上,其中4号染色体上1条,10号和17号染色体上各两条(图2)。
图表编号 | XD00136304000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.01 |
作者 | 李亚博、吕佳欣、谭冰、高彩球 |
绘制单位 | 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室、东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室、东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室、东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |